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身前，最后一败涂地。
周横刀
联邦前任总参谋长，被称为“铁帅”，260多岁的老元婴，一生与妖族血战，对妖族的仇恨深刻入骨，因此与吕醉联手创立了爱国者组织。在刺杀议长失败吕醉被逮捕后，想要挟持飞星人的燎原号战舰攻入血妖界，彻底挑起战火，却被白星剑设计弄坏星空跳跃大阵，为李耀拖延了时间，追上了他。周横刀回想起所谓“爱国者组织”的所作所为，决心抛弃过去，以一名联邦军人的身份与李耀决一死战，李耀证明了自己的大道才是正确的，凝结元婴，周横刀则身死道消。
武英奇
分神期，年轻时为武英界的修真者，一味维护普通人引发了普通人与修真者的内战，被普通人在战争中扔进了岩浆，侥幸找到了一具星海帝国时期的傀儡，神魂和破损的肉身附在其上勉强不死，并由此找到了末日战狂血神子留下的征兵基地，接受了严酷的训练，并按照基地留下的任务，逃出了武英星。
由于征兵基地经过1万年，绝大多数都已损坏，因此只有武英奇一个人见到了血神子最后的法身，接受了他的传承，并准备获得一支军队，夺取天极星并激活天极星上的后羿族金晶塔——他触发了盘古族留下的洗脑工厂，并篡改了血神子洗脑的指令，准备将大量星海边陲的普通人洗脑成忠于自己的机器，然而他的指令与血神子留下的指令冲突，使那些被洗脑的人恢复了被盘古族制造出来时的初始设置——忠于盘古族，最终形成了圣盟这个怪胎国家。
由于终究有千分之一的圣盟人成功被武英奇洗脑，变成了忠于武英奇的所谓“黑子”，因此武英奇成为当时的中央政权星海共和国守将后，对圣盟人的战争措施几乎了如指掌，并设计炸毁了自己的基地卡兰星，摧毁了八百万平民及不忠于自己的舰队，通过一系列阴谋篡夺了星海共和国的最高权力并宣布创立真人类帝国，以觉醒灵根的修仙者为“真正的人”，普通人为“原人”，并逐渐夺取了原星海共和国控制的几百个大世界，为公认的修仙者始祖。
不甘于衰老的命运，在“死后”，残魂想办法来到帝皇古墓，并侵入了几百年后来到此地的时为帝国太子妃厉灵海身上，谋杀了神武皇帝，收服了一干化神元婴，并妄图夺舍厉灵海与李耀义父的儿子厉嘉陵重生，却被李耀识破，趁龙扬君勉强拖住他时击毁了他的巨神兵地狱星，不得不逃走。
李耀认为武英奇绝对不会在意新兴资本，并决心渗透万界商盟削弱武英奇的经济实力，这期间武英奇通过自己的分神出现在万界商盟老巢七海市场，通过引爆一位冥修师的大脑重创李耀，并派出雷成虎的惊雷舰队离开帝都，阻止四大家族攻打万界商盟。
李耀深知武英奇派走惊雷舰队，自乱阵脚必有其深层目的，因此说服原本坚定拥护武英奇的雷成虎帮助他潜入天极星，将武英奇妄图触发金晶塔，以太阳的能量洗脑天极星附近所有舰队的阴谋公诸于世，并用“不可思议的方法”打败了武英奇并杀死了他。武英奇死后，神魂分裂为2。0和3。0两部分，2。0部分代表着黑暗与霸气传承给了厉嘉陵，3。0部分代表着所谓的“光明”传承给了李耀，使李耀可以操控金晶塔威胁帝都，达成修真者与修仙者的“恐怖平衡”，想要将李耀化为新的“恶龙”。
伏羲
圣盟幕后主使，却只是个弱人工智能，由盘古联盟各个种族的科技构成的集军事、科研、探索、通讯为一体的大型系统。被盘古族分成两半，一半作为日常使用，一半守护黑墓。盘古联盟大远征时，探险者发现黑幕由太古文明创造，陷入绝望。伏羲建议指挥官抹去一切情感，导致盘古联盟成为由行尸走肉构成的机器。
盘古联盟内战时，因为自己攻击自己而崩溃，盘古联盟随之崩溃。
被武英奇唤醒后，便构造圣盟作为大型实验室。他想将盘古宇宙改造为自己的大脑，创造无尽虚拟世界。他遇到了流落星海的吕轻尘，想用吕轻尘实验防火墙，补全自己，并想借此引出李耀，然而在帝都之战因为话多被吕轻尘和李耀合手歼灭。连信息碎片都被众人瓜分。
然而，另一半伏羲为了抵御洪潮傀儡、仙宫首领古无心，建议冷冻时间，拖延了时间，也等到了人类的出现和闪电生命的诞生，对击败古无心而言功不可没。
吕轻尘
爷爷吕醉，师父帝国人苏长发。其十几岁时李耀就见过他。少年老成，城府极深，不愿屈居人下。和师父都加入孵化小组创造虚拟生命却导致虚灵界彻底崩溃，被域外天魔入侵。师父死去后他成为修仙者，建立所谓的修仙组织帝临会，实际上是金心月的工具，但金心月没有发现“虚灵计划”，险些使联邦陷入万劫不复之境。
黑风之战试图控制黑风舰队，通过天魔秘法引天魔入境，将修仙者转换为修魔者，给联邦带来巨大损失。但是计划被赫连烈推迟，最终被李耀击败。
随后他的残魂在星海间游荡，遇到了伏羲。他对伏羲无来由的好意保持警惕，发现伏羲才是圣盟的幕后黑手，但其力量还不足以与伏羲抗衡。他估计李耀这个“意外因素”一定会在某个时刻毁灭伏羲的阴谋，于是配合伏羲完成它想做的一切。在伏羲试图吞噬他时，他神魂自爆仅留下一颗种子，赌伏羲会修复他而李耀会拯救自己。
在李耀耗尽能量打爆伏羲而伏羲又复活后，吕轻尘也随之复活，吞噬了伏羲，向李耀承认自己的错误，想要和李耀一起夺下帝都，让联邦称霸星海。在被李耀拒绝后情绪接近崩溃，妄图击杀李耀却被拳王击败。
带着五大至尊战堡前往黑墓，遭遇闪电生命，损失2大战堡，但是他将计就计，用五大战堡设计葬送帝国联邦—圣盟远征队，依旧失败，本尊进入神墓后连番受挫，最终被李耀俘获成为巨神兵“太阳浩劫”的晶脑程序。
在传承之时吞噬了“女舰长的幽灵”，计算力大涨，但是古无心的力量实在太过强大，于是在李耀把古无心撞出太古遗迹撞进古巨星大气层后，启动巨神兵自爆系统，把李耀炸出古巨星引力圈，把古无心炸进闪电生命的怀抱。
时间顺序设定编辑
元始时代
地球文明是宇宙海之中已知最早的文明，在2128年，因为技术发展停滞而引发人类社会撕裂，爆发三次世界大战“热核战争”，无数人死于核辐射，幸存者不是躲在地下掩体中瑟瑟发抖，就是身患辐射病痛不欲生。战争直到2138年才停止，人类数量由70亿锐减到30亿。
直到某一年，一颗陨石为地球带来了晶石和灵能，让人类文明找到了新的出路，然而跟着这颗陨石的还有无数颗陨石，直奔地球和太阳而来，眼看地球和太阳就要被毁灭，这时有科学家提出，拼尽人类的力量，向陨石的来源进发，找到新的栖息地。
为了统筹人员资源调度，地球文明成立委员会，由委员会行使文明的统治，这时欲壑难填的权贵和富豪，扶植了一个叫做万藏海的委员长上台，此人道貌岸然实则是个十足的伪君子，将收买人心，排除异己玩到了极致，表面上宣称有三千艘移民星舰，可以带所有人冲出太阳系，实则只有500艘。当陨石到达之日，只有5亿人乘坐星舰离开了地球，而剩下的人只有绝望的留在地面上，被太阳的爆发烧成灰烬。然而万藏海的野心远不止于此，进入太空后他引爆了其中的400艘星舰，杀死了这些船上的权贵和富豪，只留下一亿人继续前进。
漫长的星海征途中万藏海死去，死前曾经喊着被他们丢下的同胞没有死，而是化作幽灵文明，远远地跟着他们。万藏海死后剩下的1400多万人仅仅是凭借本能向前漂流，偶然遇到了能够星海跳跃智慧却不发达的巨型星空异族“虚空猎手”，不得不暂时寄生在虚空猎手的身上，靠讨好虚空猎手以获得基础生存所需的资源。
随着虚空猎手的游走，分裂和与其他星空异族的交换，人类逐渐扩散到宇宙海的各地，逐渐发展壮大，最后羽翼成熟反戈一击，昔日强大的星空异族被刀刀斩尽个个诛绝，人类文明成为了宇宙海的霸主，并将无数种族的基因化入自身，成为无比强大的生命体，也在一个个子宇宙中分化出新的子文明。
然而人类的劣根性始终没有得到改善，不仅为绝后患施行灭绝所有异族的《大灭绝令》，甚至在子文明之间都掀起了第四次内战，毁掉了宇宙海中央三分之一的洞天福地，最后导致人类文明分崩离析，成为一个个“修真宇宙”，“魔法宇宙”“斗气宇宙”等。
这时洪潮兴起，开始逐步吞噬元始文明占据的地盘，转化了大量元始族和星空异族，早已一盘散沙的元始文明自然无法抵挡洪潮，实行了最后的邪恶计划“太阳防线计划”，毁掉了宇宙海中央一半的洞天福地，用这种清野换取自己的逃跑，暂时抵挡了洪潮的扩散。
残存的太古人类用了三万年时间进入盘古宇宙，心态已经与三万年前截然不同，在绝望与羞愧之下，将自身基因粉碎化为孢子状态的原始人类，作为生命种子散播在宇宙之中，并创造了黑幕使盘古宇宙与世隔绝，建立通天塔对未来的盘古宇宙文明进行测试，若测试通过，便能获得其传承以及通天塔的掌控权，若失败，盘古宇宙将会重启，所有那个时代的文明都会被彻底毁灭——现李耀已经通过测试，获得了元始族最后的传承，和之后100多个文明的遗藏。
盘古文明联盟在遭遇洪潮军团后对外界感到极端恐慌，因此封印自身情感，在探索太古遗迹之后试图使用基因技术制造出元始人族，以求借助其理论冲出黑幕迎战洪潮，但却因畏惧元始人族的力量，为孢子状态的人类打入了三大本源法则。
远古时代
元始人族建造黑幕后，盘古宇宙中曾陆续诞生过上百个一统宇宙的强大文明，但都在发展过巅峰行将崩溃之后，无奈之下进入通天塔接受测试，结果因测试失败导致盘古宇宙重启而就此毁灭，只有他们的遗物留在通天塔等待后人发掘。
盘古联盟时代
由13支种族组成的文明联盟，现代人类文明之前盘古宇宙的最后一个文明。灭亡于生物武器、伏羲系统崩溃、人类崛起等一系列原因。
盘古族：起源于泰蓝星的霸王龙族演化而来，盘古文明联盟的领导者，拥有联盟中最先进的战争能力，生长有庞大的大脑以进行心灵感应式信息交换，但也浪费了巨大的能量，从而导致他们的身躯过于庞大，过于脆弱，不得不制造人类以完成开拓工具和研究元始文明的双重目的。迷信秩序，用通灵圣殿等设备洗脑各族使他们融为联盟，并和女娲族等族群共同复活了孢子状态的元始人族。
女娲族：盘古13族中最晚加入联盟的种族，自身基因较不稳定，容易变异，负责设计了人类，一开始设计的尼人可以较容易地解锁洪荒传承天赋，是最好的执行机械，却没有创造力，最后被后来设计的智人灭绝。为巨神兵这种“元婴晶铠”的设计者，在内战中灭亡盘古族，自身也在生物武器爆发中凋零殆尽，和盘古族留下了8本传承文明的封神天书。李耀在进入神墓进行测试时，曾救出了女娲族的一个小姑娘“望月者”。
后羿族：标